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首个动物重复基因数据库揭示多样性神秘
发表时间:2019-03-03
2017-06-28         

  科技日报讯 (记者张晔 通讯员许天颖)在千百万年的进化中,植物为何变得多姿多彩?一个重要因素就是植物会复制自己基因,实现物种分化跟多样性。南京农业大学张绍铃教养团队通过鉴定梨等141种植物基因组中不同类型重复基因,构建了世界首个动物重复基因数据库,揭示了重复基因进化的普遍法令。该成果近日在线发表于著名学术期刊《基因组生物学》。

  以往的研究发明,有的植物有复制本人基因的功能。基因复制后,植物不仅能抵御外界庞杂多变的环境,还能增加进化变异的机会。

  此外,该团队通过大范畴收集整合国内外植物基因组数据资源,构建了世界首个植物重复基因数据库,目前已收录141种实现基因组测序的植物,并将拓展为植物相关的所有类别。该数据库将为深刻研讨重复基因的进化机制供给宝贵的数据资源。

  近年来,越来越多的植物基因组被破译。目前已经完成全基因组测序的植物超过200种。然而,仍缺乏一个存在广泛适用性的鉴定不同品种植物重复基因的方法。该团队在系统鉴定梨基因组中重复基因的基础上,开发了一个具备普遍实用性的生物信息学措施,用于鉴定不同种类植物基因组中的重复基因。

  他们深入分析发现,在植物漫长的进化过程中,基因串联复制跟邻近复制始终保持较高的产生频率,为动物适应复杂多变的外界环境供应了源源始终的遗传变异材料。并且,基因组加倍发生后的较短时间内,重复基因之间发生高频率的基因置换,随着时光的推移,反复基因之间会发生广泛的时空表白分化。


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